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- Instituto de Ciências Farmacêuticas 204
- Instituto de Computação 162
- Instituto de Comunicação e Informação Científica e Tecnológica em Saúde 1
- Instituto de Economia 1917
- Instituto de Enfermagem 101
- Instituto de Estudos da Linguagem 1
- Instituto de Estudos em Saúde Coletiva 144
- Instituto de Filosofia e Ciências Sociais 50
- Instituto de Física 194
- Instituto de Geociências 845
- Instituto de História 115
- Instituto de Macromoléculas Professora Eloisa Mano 16
- Instituto de Matemática 35
- Instituto de Microbiologia Paulo de Góes 169
- Instituto de Nutrição Josué de Castro 21
- Instituto de Pesquisa e Planejamento Urbano e Regional 518
- Instituto de Pesquisas de Produtos Naturais Walter Mors 7
- Instituto de Psicologia 18
- Instituto de Psiquiatria 2
- Instituto de Puericultura e Pediatria Martagão Gesteira 3