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- Instituto de Bioquímica Médica 13
- Instituto de Ciências Biomédicas 35
- Instituto de Ciências Farmacêuticas 204
- Instituto de Computação 206
- Instituto de Comunicação e Informação Científica e Tecnológica em Saúde 1
- Instituto de Economia 1980
- Instituto de Enfermagem 119
- Instituto de Estudos da Linguagem 1
- Instituto de Estudos em Saúde Coletiva 152
- Instituto de Filosofia e Ciências Sociais 50
- Instituto de Física 204
- Instituto de Geociências 879
- Instituto de História 116
- Instituto de Macromoléculas Professora Eloisa Mano 16
- Instituto de Matemática 45
- Instituto de Microbiologia Paulo de Góes 190
- Instituto de Nutrição Josué de Castro 21
- Instituto de Pesquisa e Planejamento Urbano e Regional 558
- Instituto de Pesquisas de Produtos Naturais Walter Mors 7
- Instituto de Psicologia 19