Micro-organismos de recifes de coral de oceano profundo: isolamento, identificação e filogenia

Medeiros, Laenne Gomes de

Please use this identifier to cite or link to this item: http://hdl.handle.net/11422/20627

Type:	Trabalho de conclusão de graduação
Title:	Micro-organismos de recifes de coral de oceano profundo: isolamento, identificação e filogenia
Author(s)/Inventor(s):	Medeiros, Laenne Gomes de
Advisor:	Carmo, Flávia Lima do
Co-advisor:	Vilela, Caren Leite Spindola
Abstract:	Os corais e esponjas de oceano profundo estabelecem associações simbióticas únicas com micro-organismos diversos, que apresentam funções chaves para o funcionamento do ecossistema, como a ciclagem biogeoquímica, produção de compostos antimicrobianos e degradação de compostos tóxicos. A relação hospedeiro-micro-organismo é essencial para garantir a saúde e sobrevivência dos animais neste ambiente considerado extremo, devido à ausência de luz, alta pressão hidrostática, pouca disponibilidade de nutrientes e baixas temperaturas. Ainda, os micro-organismos de oceano profundo podem ser importantes fontes de produtos com aplicações biotecnológicas, que podem ser utilizados para fins de conservação dos recifes de coral frente a distúrbios causados por diversos fatores. Diante disso, este trabalho tem como objetivo isolar micro-organismos de amostras de recifes de coral de oceano profundo (corais, esponjas, água e sedimento), com o uso de técnicas de microbiologia tradicional, como o cultivo e isolamento em meios de cultura ricos e/ou seletivos, e ainda identificar os isolados através do sequenciamento do gene rRNA 16S para afiliação filogenética. Para isso, as amostras foram coletadas durante a expedição oceanográfica do projeto PROBIO-DEEP, na Bacia de Campos, RJ nas profundidades de 600-800 m, em cinco pontos de coleta. Ainda a bordo, as amostras foram processadas para o cultivo dos micro-organismos em 16 meios de cultura, com o plaqueamento e inóculo de 100μl em meios sólidos ou líquidos, com incubação a 6°C e 26° C até que se observasse crescimento. Os isolados obtidos tiveram seu DNA extraído e foram identificados pelo sequenciamento do gene rRNA 16S. As sequências foram analisadas por meio da plataforma Sanger Pipeline do Ribossomal Database Project (RDP), e os contigs e a árvore filogenética montados pelos softwares Bioedit e MEGA X, respectivamente. O cultivo microbiano possibilitou o isolamento de 286 estirpes bacterianas, distribuídas nos filos Proteobacteria, Actinobacteria, Firmicutes e Bacteriodetes, em ordem de abundância. Um total de 37 gêneros microbianos foram obtidos, sendo o gênero Pseudoalteromonas predominante nas amostras de coral e esponja. Nos corais, os gêneros Acinetobacter (21%) e Vibrio (15%) também foram abundantes. Nas esponjas, o gênero Photobacterium foi dominante, com 22 isolados (15.9%), seguido de Moritella (13%) e Acinetobacter (10.8%). As amostras de água tiveram a predominância do gênero Bacillus (23%), seguido de Pseudoalteromonas (18%) e Erythrobacter (17%). Os resultados do sequenciamento e afiliação filogenética demonstraram que alguns micro-organismos apresentam a possibilidade de serem espécies ou até mesmo gêneros novos, devido às baixas similaridades com as sequências dos bancos de dados (<95%). Este dado indica a importância de estudos mais aprofundados acerca dos micro-organismos de oceano profundo como forma de identificar possíveis novas espécies e metabolismos, que podem ser utilizados em futuras aplicações biotecnológicas e como ferramenta de monitoramento e conservação desses recifes.
Keywords:	Oceano profundo Biologia molecular Filogenia Deep sea Molecular biology Phylogeny
Subject CNPq:	CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::MICROBIOLOGIA CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::IMUNOLOGIA
Production unit:	Instituto de Microbiologia Paulo de Góes
Publisher:	Universidade Federal do Rio de Janeiro
Issue Date:	15-Dec-2022
Publisher country:	Brasil
Language:	por
Right access:	Acesso Aberto
Citation:	MEDEIROS, L. G. de. (2022). Micro-organismos de recifes de coral de oceano profundo: isolamento, identificação e filogenia [Trabalho de conclusão de curso, Universidade Federal do Rio de Janeiro]. Repositório Institucional Pantheon.
Appears in Collections:	Ciências Biológicas - Microbiologia e Imunologia

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