Análise da linhagem pandêmica ST131 de Escherichia coli isolada de infecção urinária na era pós-COVID-19 no Rio de Janeiro

Pereira, Juliana Jandre Sueiro de Souza

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			http://hdl.handle.net/11422/27133

Type:	Trabalho de conclusão de graduação
Title:	Análise da linhagem pandêmica ST131 de Escherichia coli isolada de infecção urinária na era pós-COVID-19 no Rio de Janeiro
Author(s)/Inventor(s):	Pereira, Juliana Jandre Sueiro de Souza
Advisor:	Miranda, Karla Rodrigues
Co-advisor:	Barcellos, Isadora Silva
Abstract:	Escherichia coli é um bacilo da microbiota intestinal de seres humanos que pode migrar para outros sítios do organismo e causar doenças. Cepas que causam infecção no trato urinário (ITU) são chamadas de E. coli uropatogênicas (UPEC), podendo ser classificadas em grupos filogenéticos e sequence type (ST). A linhagem ST131 do grupo filogenético B2 é considerada um clone de alto risco e é a principal responsável por este tipo de infecção no mundo, podendo ser dividida em clados A, B e C, e subclados C1, C1-M27 e C2. Estudos anteriores do nosso grupo avaliaram dados de cepas de UPEC obtidas de ITU adquiridas na comunidade (ITU-AC) no Rio de Janeiro nos anos de 2005, 2015 e 2019. A frequência de ST131 aumentou significativamente de 2% em 2005 para 9% em 2015 (p=0,003), e posteriormente 14% em 2019 (p=0,001). Durante a pandemia de COVID-19, o uso excessivo de antimicrobianos foi associado a um aumento de microrganismos multirresistentes. Com isso, o presente estudo teve como objetivo estabelecer uma nova coleção de UPEC, avaliar as características moleculares, fenotípicas e demográficas de cepas de E. coli ST131 isoladas de ITU-AC em 2024, traçando uma evolução da linhagem comparando com os estudos prévios das coleções anteriores. Após a confirmação da espécie por MALDI-TOF, foi realizada a tipificação por grupo filogenético, ST e clado através de PCR multiplex. As amostras categorizadas como ST131 foram submetidas aos testes de susceptibilidade aos antimicrobianos. Os dados obtidos passaram por análises estatísticas comparando a prevalência de ITU e do ST131 entre faixas etárias e sexo, com significância estatística estabelecida em p ≤ 0,05). De 960 amostras identificadas como E. coli, 461 (48%) pertencem ao grupo B2, representando um aumento significativo comparado à coleção de 2015, com 30% (n=150) sendo B2 (p<0,0000001). O ST131 foi o mais frequente do grupo B2, representando 22% (n=461) da coleção, mais frequente em idosos (61%) e no sexo feminino (86%). Apesar de ainda ser o ST mais isolado, apresentou redução em comparação à coleção de 2019 (de 14% para 10%, p=0,01). O clado A foi o mais frequente, representado por 29% (n=29) das amostras, e o C2 apresentou uma queda significativa entre as coleções de 2019 e 2024, de 24% para 9% (p=0,001). Comparado às coleções anteriores, o ST131 se apresentou mais sensível a betalactâmicos e monobactâmicos, mas a produção de ESBL permaneceu estável (23%). Todas as amostras do subclado C1-M27 foram produtoras de ESBL e 4 do C2 (44%). Um total de 45% das amostras de ST131 demonstrou um perfil MDR, com uma participação significativa do clado C (66%) (p=0,001). O clado C também apresentou uma taxa significativa de resistência a ciprofloxacina (97%) quando comparado a outras sublinhagens de ST131 (16%) (p<0,001). O ST131, apesar de demonstrar queda entre as coletas de 2019 e 2024, ainda é uma linhagem considerada de grande preocupação global e que precisa ser monitorada no Rio de Janeiro, principalmente devido à sua capacidade de disseminação de resistência a antimicrobianos.
Keywords:	Escherichia coli Infecção do trato urinário Resistência microbiana a medicamentos Urinary tract infection Drug resistance
Subject CNPq:	CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::MICROBIOLOGIA CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::IMUNOLOGIA
Production unit:	Instituto de Microbiologia Paulo de Góes
Publisher:	Universidade Federal do Rio de Janeiro
Issue Date:	16-Jul-2025
Publisher country:	Brasil
Language:	por
Right access:	Acesso Aberto
Citation:	PEREIRA, J. J. S. de S. (2025). Análise da linhagem pandêmica ST131 de Escherichia coli isolada de infecção urinária na era pós-COVID-19 no Rio de Janeiro [Trabalho de Conclusão de Curso, Universidade Federal do Rio de Janeiro]. Repositório Institucional Pantheon.
Appears in Collections:	Ciências Biológicas - Microbiologia e Imunologia

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