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http://hdl.handle.net/11422/28636
| Type: | Trabalho de conclusão de graduação |
| Title: | Exploração de dados públicos para investigação in silico de genes relacionados a eosinófilos no câncer de mama |
| Author(s)/Inventor(s): | Clemente, Tamires Avila de Souza |
| Advisor: | Diaz, Bruno Lourenço |
| Co-advisor: | Cunha, Fernanda Neves da |
| Abstract: | O câncer de mama é responsável pela segunda maior taxa de incidência e quarta de mortalidade (excluindo câncer de pele não melanoma) mundialmente, com as mulheres respondendo por cerca de 99% dos casos e com apenas 1% de homens, sendo a primeira causa de morte por câncer entre as mulheres. O carcinoma mamário é composto por um microambiente tumoral heterogêneo que compreende células do estroma e epiteliais, envolvendo células tumorais, fibroblastos associados ao tumor (CAFs), e células do sistema imunológico infiltradas. Dentre os leucócitos, os eosinófilos são granulócitos classicamente associados a quadros de alergia e infestação parasitária. Contudo, no contexto do câncer, seu papel é destacado de forma contraditória, em que a infiltração no tecido tumoral de mama é frequentemente correlacionada a um bom prognóstico. A análise in silico de dados de transcriptomas de repositórios públicos permite analisar a expressão gênica e entender a interação de genes relevantes ao metabolismo do organismo. Assim, nosso estudo tem como objetivo analisar a expressão gênica e a interação de genes associados à presença de eosinófilos no microambiente tumoral do câncer de mama por assinaturas gênicas que modulam a presença ou a função desses granulócitos no tumor. Para investigar alterações envolvidas na progressão tumoral pela presença, pelo recrutamento e manutenção de eosinófilos nesse tecido, examinamos dados de RNAseq obtidos de amostras do tecido adjacente ao tumor, do repositório público TCGA, utilizando ferramentas de bioinformática pela linguagem de programação Python, visualizando os dados resultantes pelas bibliotecas Matplotlib, Pandas, Seaborn e Lifelines. Os resultados apresentaram um perfil de mau prognóstico com relação a presença de eosinófilos, que é definida a partir da expressão dos genes avaliados Galectina 10 (CLC), EPX (EPO), IL5RA, PRG2 (MBP), pela maior expressão de CLC no subtipo mais agressivo, Basal-like, além de observarmos a presença do infiltrado eosinofílico em todos os tumores avaliados, apesar do grau de agressividade, por meio da expressão de EPX e PRG2. Para recrutamento, definido pela expressão dos genes CCL11 (Eotaxina 1), CCL24 (Eotaxina 2) e CCL26 (Eotaxina 3), observamos um perfil associado ao bom prognóstico, pela alta presença de CCL11, importante na formação da mama, além da maior distribuição nos subtipos de melhor desfecho clínico. Por sua vez, a manutenção de eosinófilos, avaliado pela expressão gênica de IL33, IL25, IL5 e TSLP, mostrou um perfil associado ao mau prognóstico, pela expressão aumentada de IL5 no subtipo de maior agressividade. Assim, apesar da disponibilidade de poucos estudos na literatura acerca da eosinofilia no contexto do câncer, nossos dados condizem com os trabalhos descritos na literatura, sugerindo uma contrariedade em relação ao papel dos eosinófilos no câncer de mama, ainda que os mecanismos referentes a essa relação não sejam completamente conhecidos. |
| Keywords: | Neoplasias da mama Eosinófilos Transcriptoma Breast neoplasms Eosinophils Transcriptome |
| Subject CNPq: | CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::MICROBIOLOGIA CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::IMUNOLOGIA |
| Production unit: | Instituto de Microbiologia Paulo de Góes |
| Publisher: | Universidade Federal do Rio de Janeiro |
| Issue Date: | 8-Dec-2025 |
| Publisher country: | Brasil |
| Language: | por |
| Right access: | Acesso Aberto |
| Citation: | Clemente, T. A. S. (2025). Exploração de dados públicos para investigação in silico de genes relacionados a eosinófilos no câncer de mama [Trabalho de Conclusão de Curso, Universidade Federal do Rio de Janeiro]. Repositório Institucional Pantheon. |
| Appears in Collections: | Ciências Biológicas - Microbiologia e Imunologia |
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