Protocolo de segmentação manual de ressonância magnética estrutural do córtex e determinação das suas incertezas

Fernandez, Natália Freitas

Please use this identifier to cite or link to this item:


			http://hdl.handle.net/11422/29668

Type:	Trabalho de conclusão de graduação
Title:	Protocolo de segmentação manual de ressonância magnética estrutural do córtex e determinação das suas incertezas
Author(s)/Inventor(s):	Fernandez, Natália Freitas
Advisor:	Mota, Bruno Coelho César
Co-advisor:	Moraes, Fernanda Hansen P. de
Abstract:	O trabalho apresentado se desenvolveu a partir da necessidade de uma alternativa para a segmentação de ressonâncias magnéticas estruturais cerebrais de maneira a abranger os indivíduos não contemplados pelos métodos automáticos já utilizados, em especial o FreeSurfer. Foi feita a segmentação manual, fatia a fatia, de uma imagem de ressonância magnética estrutural cerebral em duas vistas, coronal e axial, e definido um protocolo detalhado para garantir a reprodutibilidade das etapas. O protocolo foi validado utilizando tanto resultados de ferramentas de segmentações automáticas, quanto soluções analíticas e uma solução automática para reconstrução tridimensional das superfícies. Para se calcular as variáveis morfométricas desejadas, que são o volume total e área externa das substâncias branca (WM) e cinzenta (GM), a partir da segmentação manual feita, foram utilizados dois métodos. O primeiro, foi o uso de duas fórmulas que propõem uma maneira de se somar os valores de perímetro e área de cada fatia para obter a área lateral e o volume total do córtex e da substância branca do cérebro, e o segundo foi a reconstrução do córtex com o uso do programa Stitcher, que gera os valores de maneira automática. Foi então feita a comparação dos valores obtidos pelo primeiro método de segmentação manual (cujo calculo é feito pelas fórmulas) com os valores obtidos automaticamente pela segmentação e reconstrução usando o FreeSurfer. Os erros relativos obtidos para a segmentação manual em vista coronal, em relação ao valor de referência fornecido pelo método automático, foram de -2% para a área da substância branca, 11% para a área da substância cinzenta, de -4% para o volume da substância branca e -13% para o volume de substância cinzenta. Os valores de erro relativo da segmentação manual em plano axial quando comparada com o método automático foram de 4% para a área da substância branca, 11% para a área da substância cinzenta, de -7% para o volume da substância branca e -14% para o volume de substância cinzenta. Todos os outros valores para a análise principal estão abaixo de 15%, o que mostra a qualidade do método e a possibilidade de desenvolvê-lo como alternativa.
Keywords:	Segmentação manual Morfometria cerebral Ressonância magnética
Subject CNPq:	CNPQ::CIENCIAS EXATAS E DA TERRA::FISICA
Production unit:	Instituto de Física
Publisher:	Universidade Federal do Rio de Janeiro
Issue Date:	2023
Publisher country:	Brasil
Language:	por
Right access:	Acesso Aberto
Appears in Collections:	Física Médica

Files in This Item:

File	Description	Size	Format
NFFernandez.pdf		3.08 MB	Adobe PDF	View/Open

Show full item record Recommend this item View Statistics

Pantheon Institutional repository