Dinâmica conformacional dos domínios aminoterminais RRM1-2 do regulador pós-transcricional HuR

Jendiroba, Kleber Avila

Please use this identifier to cite or link to this item: http://hdl.handle.net/11422/5685

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DC Field	Value	Language
dc.contributor.advisor	Pinheiro, Anderson de Sá	-
dc.contributor.author	Jendiroba, Kleber Avila	-
dc.date.accessioned	2018-11-08T17:32:29Z	-
dc.date.available	2023-12-21T03:04:13Z	-
dc.date.issued	2016-12-16	-
dc.identifier.uri	http://hdl.handle.net/11422/5685	-
dc.language	por	pt_BR
dc.publisher	Universidade Federal do Rio de Janeiro	pt_BR
dc.rights	Acesso Aberto	pt_BR
dc.subject	Domínios RRM1-2	pt_BR
dc.subject	Regulador pós-Transcricional HuR	pt_BR
dc.title	Dinâmica conformacional dos domínios aminoterminais RRM1-2 do regulador pós-transcricional HuR	pt_BR
dc.type	Trabalho de conclusão de graduação	pt_BR
dc.contributor.advisorLattes	http://lattes.cnpq.br/3773354236475553	pt_BR
dc.contributor.authorLattes	http://lattes.cnpq.br/9348437464996653	pt_BR
dc.contributor.referee1	Magalhães, Mariana Torquato Quezado de	-
dc.contributor.referee1Lattes	http://lattes.cnpq.br/2451904384119263	pt_BR
dc.contributor.referee2	Horta, Bruno Araujo Cautiero	-
dc.contributor.referee2Lattes	http://lattes.cnpq.br/0146165943413476	pt_BR
dc.description.resumo	O antígeno humano R (HuR) atua como regulador pós-transcricional da expressão gênica através da sua atividade estabilizadora de RNA mensageiro. HuR é composta por três domínios funcionalmente distintos denominados motivos de reconhecimento de RNA (RRM, do inglês “RNA Recognition Motif”). Os domínios amino-terminais RRM1 e RRM2, dispostos em tandem, são responsáveis pela interação da proteína com sequências ricas em adenina e uracila presentes na região 3’ não-traduzida do mRNA. O presente trabalho teve como objetivo a caraterização dinâmica do domínio RRM1-2 de HuR por Ressonância Magnética Nuclear (RMN) e mobilidade iônica acoplada à espectrometria de massa (IMMS), buscando esclarecer o mecanismo pelo qual HuR reconhece de maneira específica seus alvos de RNA. Com base do RMN multimensional em alta resolução, foi possível assinalar 98% das ressonâncias de RRM1-21-189, com exceção dos resíduos Met1, Ile152, Ile179 e os artefatos de clonagem N- e Cterminais. Durante o processo, foi observado a presença de ressonâncias extras no espectro de [1H,15N] HSQC, sugerindo, pelo menos, uma segunda conformação minoritária em solução. O fato dos deslocamentos químicos do RRM1 tanto isolado quanto no tandem RRM1-2 se mostrar semelhante, sugere ausência de contatos entre os domínios N-terminais. A região N-terminal que é intrinsicamente desordenada e o “linker” entre os domínios são altamente flexíveis, como demonstram os resultados de dinâmica. Além disso, as alças L3 (RRM1), L3’ e L5’ (RRM2) experimentam dinâmica térmica. O valor de c estimado para RRM1-21-189 comparado a de uma proteína globular de massa molecular similar sugere um comportamento dos domínios RRM1 e RRM2 como módulos independentes em solução. O tandem RRM1-21-189 não experimenta troca conformacional em regime intermediário, como indicam os dados de dispersão de relaxação. Porém, foi observado que determinados resíduos apresentam, nas frequências intermediárias, um aumento de R2eff, sugerindo um regime de troca mais lento. Os dados de ESI-IM-MS sugerem que RRM1-21-189 na forma livre apresenta três conformações co-populadas. Esses resultados sugerem que a dinâmica na interação da HuR com seus substratos de RNA segue um mecanismo de seleção conformacional.	pt_BR
dc.publisher.country	Brasil	pt_BR
dc.publisher.department	Instituto de Química	pt_BR
dc.publisher.initials	UFRJ	pt_BR
dc.subject.cnpq	CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::BIOQUIMICA	pt_BR
dc.subject.cnpq	CNPQ::CIENCIAS EXATAS E DA TERRA::QUIMICA::QUIMICA ORGANICA	pt_BR
dc.embargo.terms	aberto	pt_BR
Appears in Collections:	Química

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