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Type: Trabalho de conclusão de graduação
Title: Clone ST95 como causa de infecções por Escherichia coli no estado do Rio de Janeiro
Author(s)/Inventor(s): Barbosa, Mariana Anjo
Advisor: Moreira, Beatriz Meurer
Co-advisor: Castro, Eduardo Moreira de
Abstract: Escherichia coli patogênica extraintestinal (ExPEC), mais especificamente o patotipo E. coli uropatogênica (UPEC), é a principal causa de infecção de trato urinário (ITU) e são frequentemente identificados em infecção de corrente sanguínea (ICS). Dentre as principais linhagens pandêmicas de ExPEC, definidas por MLST, estão ST131 e ST95. Amostras do ST95 são identificadas com alta prevalência em ITU e ICS em vários países. Contudo, no Brasil, entre os poucos estudos realizados, foi descrita frequência alta de clones da linhagem ST131 e baixa de ST95. Os motivos dessa diferença não são claros, mas o predomínio do ST131 no Brasil pode ser associado à alta proporção de resistência a antimicrobianos entre as amostras desse ST. Já as cepas do ST95 apresentam maior susceptibilidade a antimicrobianos e sua baixa prevalência no Brasil permanece pouco explorada. Neste estudo propomos a análise de uma coleção de amostras de E. coli oriundas de indivíduos com ITU diagnosticada na comunidade, obtidas nos anos de 2005 (n =139), 2015 (n =499) e 2019 (n =937) no Rio de Janeiro e de uma coleção de amostras isoladas de ICS obtidas em 2013 a 2015 (n =166). Foi investigada a frequência das amostras e o perfil de susceptibilidade a antimicrobianos de E. coli do ST95 no Rio de Janeiro, características que posteriormente associadas com outras análises permitirão compreender melhor a tendência da baixa frequência e maior susceptibilidade aos antimicrobianos dessa linhagem. As amostras de 2019 foram previamente identificadas e o perfil de susceptibilidade a antimicrobianos determinado pelo VITEK. A tipificação da linhagem foi realizada por meio de PCR específico para identificação do ST95. As outras coleções haviam sido previamente tipificadas. No presente estudo, as amostras do ST95 foram identificadas por MALDI-TOF MS, e susceptibilidade a antimicrobianos e de produção de betalactamases de espectro estendido (ESBL) foram determinadas por disco-difusão. Nas coleções de ITU, amostras ST95 representam 1,4% (n = 2) e 0,8% (n = 4) das coleções de 2005 e 2015, respectivamente, e 2,5% (n = 24) na coleção de 2019, que constituiu em aumento significativo (p<0,05). Foi detectada resistência a 12 dos 16 antimicrobianos testados, contudo, maioria das amostras apresentaram altas taxas de susceptibilidade aos antimicrobianos testados, sendo 66,6% (n=20/30) nas coleções de ITU e 50% (n=4/8) na de ICS. Ampicilina e sulfametoxazoltrimetoprim foram os antimicrobianos em que se observou maior número de amostras nãosusceptíveis. Entre todas as amostras utilizadas no estudo uma, pertencente à coleção oriunda de ITU de 2019, foi identificada como multirresistente e produtora de ESBL. Em suma, amostras ST95 coletadas no Rio de Janeiro apresentam manutenção de baixa prevalência e altas taxas de susceptibilidade. Análises de outros fatores associados a esses resultados ainda precisam ser realizadas.
Keywords: Escherichia coli
Anti-infecciosos
Anti-infective agents
Subject CNPq: CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::MICROBIOLOGIA
CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::IMUNOLOGIA
Production unit: Instituto de Microbiologia Paulo de Góes
Publisher: Universidade Federal do Rio de Janeiro
Issue Date: 13-May-2021
Publisher country: Brasil
Language: por
Right access: Acesso Aberto
Citation: BARBOSA, M. A. (2021). Clone ST95 como causa de infecções por Escherichia coli no estado do Rio de Janeiro [Trabalho de Conclusão de Curso, Universidade Federal do Rio de Janeiro]. Repositório Institucional Pantheon.
Appears in Collections:Ciências Biológicas - Microbiologia e Imunologia

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