Please use this identifier to cite or link to this item: http://hdl.handle.net/11422/13035
Type: Dissertação
Title: Deep learning for corpus callosum segmentation in brain magnetic resonance images
Other Titles: Aprendizado profundo para segmentação do corpo caloso em imagens de ressonância magnética do cérebro
Author(s)/Inventor(s): Silva, Flávio Henrique Schuindt da
Advisor: Farias, Ricardo Cordeiro de
Abstract: Apresentamos neste trabalho um novo método para segmentar o Corpo Caloso em imagens de ressonância magnética (MRI) usando U-Net, uma rede puramente convolucional. Treinamos a U-Net usando dois datasets públicos e validamos o modelo treinado em um conjunto de teste também obtido a partir destes datasets públicos. Os resultados são obtidos realizando comparações usando o Índice de Similaridade Estrutural (SSIM) e o coeficiente Dice entre a imagem gabarito e a imagem gerada pelo modelo.
Abstract: In this work we present a novel method to segment Corpus Callosum in Magnetic Resonance Images (MRI) using U-Net, a Fully Convolutional Neural Network. We trained the U-Net using two public datasets and evaluated the trained model in a test set also obtained from these two public datasets. Results are obtained making comparisons using the Structural Similarity Index (SSIM) and Dice Coefficient between the Ground Truth and the Predicted image.
Keywords: Deep Learning
Machine Learning
Healthcare
Brain
MRI
U-Net
Image Segmentation
Python
Tensorflow
Keras
Subject CNPq: CNPQ::ENGENHARIAS
Program: Programa de Pós-Graduação em Engenharia de Sistemas e Computação
Production unit: Instituto Alberto Luiz Coimbra de Pós-Graduação e Pesquisa de Engenharia
Publisher: Universidade Federal do Rio de Janeiro
Issue Date: Mar-2018
Publisher country: Brasil
Language: eng
Right access: Acesso Aberto
Appears in Collections:Engenharia de Sistemas e Computação

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