Caracterização fenotípica e genotípica de amostras de Streptococcus pneumoniae isoladas de infecções durante a pandemia da COVID-19

Aquino, David Ribeiro

Please use this identifier to cite or link to this item: http://hdl.handle.net/11422/21894

Type:	Trabalho de conclusão de graduação
Title:	Caracterização fenotípica e genotípica de amostras de Streptococcus pneumoniae isoladas de infecções durante a pandemia da COVID-19
Author(s)/Inventor(s):	Aquino, David Ribeiro
Advisor:	Teixeira, Lucia Martins
Co-advisor:	Botelho, Ana Caroline Nunes
Abstract:	Streptococcus pneumoniae, comumente referido como pneumococo, é considerado um importante agente causador de infecções graves, tais como pneumonia, bacteremia e meningite, principalmente em crianças de até cinco anos, idosos e indivíduos imunocomprometidos. A cápsula é o principal fator de virulência deste microrganismo e a base para as vacinas atualmente disponíveis. Após a implementação do uso de vacinas, mudanças na distribuição de tipos capsulares de S. pneumoniae foram percebidas, assim como nos percentuais de resistência aos antimicrobianos, incluindo à penicilina, demandando monitoramento contínuo. O objetivo deste trabalho foi caracterizar fenotípica e genotipicamente amostras de S. pneumoniae isoladas durante a pandemia de COVID-19 e obter dados sobre a distribuição de tipos capsulares e os perfis de resistência aos antimicrobianos e virulência de amostras associadas às doenças pneumocócicas graves, ocorridas nesse período. Foram estudadas 60 amostras de pneumococos, isoladas de diferentes espécimes clínicos, majoritariamente sangue (83%), obtidos de pacientes hospitalizados com quadros de infecções pneumocócicas em diferentes unidades de saúde do Rio de Janeiro. Tais amostras foram submetidas aos testes fenotípicos convencionais para confirmação da identificação. A metodologia de MALDI-TOF MS também foi realizada, assim como a amplificação do gene lytA (específico da espécie). Todas as amostras foram confirmadas como pertencentes à espécie S. pneumoniae, seja pelos resultados típicos nos testes fenotípicos, seja pela obtenção de escores de confiabilidade no MALDI-TOF MS, além da amplificação do gene lytA. Testes de susceptibilidade aos antimicrobianos foram realizados por meio da técnica de disco-difusão, seguindo as recomendações do CLSI. Foram observados os seguintes percentuais de resistência a antimicrobianos: clindamicina (28,3%; 17), cloranfenicol (1,6%; 1), eritromicina (33,3%; 20), penicilina (31,7%; 19), sulfametoxazol-trimetoprim (41,6%; 25) e tetraciclina (41,6%; 25). Todas as amostras foram suscetíveis à levofloxacina, à rifampicina e à vancomicina. Foi observado que 20 (33,3%) amostras possuíam perfis de multrresistência. As concentrações mínimas inibitórias (CMIs), de penicilina foram determinadas para as amostras que se apresentaram não susceptíveis à penicilina, e variaram de 0,047µg/mL à 32µg/mL. Nas amostras que apresentaram o fenótipo de resistência aos macrolídeos (eritromicina) e lincosamidas (clindamicina), foi pesquisada a presença dos genes ermA, ermB e mefA por meio de PCR uniplex. O gene ermB foi o predominante (28,35%; 17 das 60 amostras), seguido do gene mefA (18,3%; 11 das 60 amostras), e o gene ermA não foi detectado. O gene ermB foi detectado em 17 (85%) dessasamostras que apresentaram fenótipo de resistência aos macrolídeos e lincosamidas, compreendendo 9 (45%) amostras que albergavam somente o gene ermB e 8 (40%) que também albergavam mefA. O gene mefA foi observado em 11 (18,3%) amostras, incluindo 3 (27,3%) que carreavam somente mefA e as 8 (72,7%) que também possuíam o gene ermB. Genes codificadores de pili dos tipos I e II foram investigados por PCR uniplex, sendo identificada a presença das seguintes estruturas associadas à virulência: pilus do tipo I (21,6%; 13) e pilus do tipo II (20%; 12). Os tipos capsulares foram determinados por testes de PCR multiplex, e os mais frequentes foram: 19A (20%; 12), 3 (10%; 6), 6 (5%; 3), 12 (5%; 3) e 7F/7A (5%; 3). Dessa forma, percebeu-se que os sorotipos mais frequentemente encontrados não pertencem à formulação da vacina que é amplamente disponibilizada no sistema de saúde público brasileiro, além disso, o sorotipo 19A é comumente associado aos casos de infecções pneumocócicas invasivas e à multirresistência. Sendo assim, o presente estudo contribui com dados atuais sobre a resistência aos antimicrobianos e os perfis de multirresistência dos pneumococos circulantes em nossa região, assim como da presença de fatores de virulência (pili) que facilitam a colonização no hospedeiro e que podem se tornar alvos vacinais no futuro e, sobretudo, da distribuição dos tipos capsulares que foram responsáveis pelos casos de infecções pneumocócicas ocorridos no período de investigação. Que seja de nosso conhecimento, este é o primeiro estudo relatando as características de amostras de pneumococos circulando durante o período da pandemia de COVID-19 no Rio de Janeiro.
Keywords:	Streptococcus pneumoniae Virulência COVID-19 Resistência microbiana a medicamentos Doenças transmissíveis Microbiologia Sorogrupo Genes
Subject CNPq:	CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::MICROBIOLOGIA::BIOLOGIA E FISIOLOGIA DOS MICROORGANISMOS
Production unit:	Campus Duque de Caxias Professor Geraldo Cidade
Publisher:	Universidade Federal do Rio de Janeiro
Issue Date:	27-Jun-2023
Publisher country:	Brasil
Language:	por
Right access:	Acesso Aberto
Citation:	AQUINO, David Ribeiro. Caracterização fenotípica e genotípica de amostras de Streptococcus pneumoniae isoladas de infecções durante a pandemia da Covid-19. 2023. 67 f. Trabalho de conclusão de curso (Bacharelado em Ciências Biológicas: Biotecnologia) - Campus Duque de Caxias Professor Geraldo Cidade, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Duque de Caxias, 2023.
Appears in Collections:	Ciências Biológicas - Biotecnologia

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