Identificação e caracterização molecular de perfis de virulência de Salmonella sp. obtidas a partir de águas superficiais de regiões agrícolas do Rio de Janeiro
| dc.contributor.advisor | Bonelli, Raquel Regina | |
| dc.contributor.advisorCo1 | Kraychete, Gabriela Bergiante | |
| dc.contributor.referee1 | Ferreira, Eliane de Oliveira | |
| dc.contributor.referee2 | Martins, Alice Gonçalves | |
| dc.contributor.referee3 | Esteves, Matheus de Assis Côrtes | |
| dc.creator | Moura, Vinicius de Carvalho | |
| dc.creator.Lattes | http://lattes.cnpq.br/8492566884783048 | pt_BR |
| dc.date.accessioned | 2023-06-01T17:07:15Z | |
| dc.date.available | 2026-05-16T03:01:03Z | |
| dc.date.issued | 2023-01-12 | |
| dc.description.resumo | O gênero Salmonella tem duas espécies S. enterica e S. bongori. A primeira conta com seis subespécies (S. enterica, S. salamae, S. arizonae, S. diarizonae, S. houtenae e S. indica) e mais de 2.600 sorovares; enquanto a segunda apresenta 23 sorovares. O gênero representa microrganismos enteropatogênicos, disseminados por fontes aquáticas, água de consumo e alimentos, em geral, de origem animal, sendo o gênero um importante causador de doenças de transmissão hídrica e alimentar (DTHA). O gênero bacteriano é um risco, também, à economia associada a sistemas de saúde e ao setor agropecuário. O objetivo do presente estudo foi identificar e avaliar a diversidade de isolados de Salmonella sp. obtidas em águas impactadas por atividade agrícola em duas grandes regiões do estado do Rio de Janeiro, Vassouras e São José do Vale do Rio Preto (SJVRP) e pesquisar a ocorrência de genes de virulência nestas mesmas amostras. Um total de 184 isolados, provenientes de 58 amostras de água, obtidas em 57 diferentes pontos de coleta, foram analisados. Para o processamento foram utilizados água peptonada, caldos de enriquecimento seletivo, como Rappaport-Vassiliadis e Tetrationato, meios diferenciais seletivos, como Ágar Salmonella-Shigella (SS) e Ágar Xilose-Lisina Tergitol-4 (XLT4). Foi realizada uma identificação presuntiva pela morfologia das colônias isoladas nos meios e a confirmação de gênero pelo espectrômetro de massas Matrix Assisted Laser Desorption Ionization – Time off Flight Mass Spectrometry (MALDI-TOF MS). Todos os isolados confirmados como pertencentes ao gênero bacteriano, identificados presuntivamente como não clonais pela técnica de random amplification polymorphic DNA (RAPD), foram enviados para sequenciamento e os genomas analisados in silico. Segundo as análises pelo programa SeqSero2, foram identificados 31 sorovares na coleção de amostras, sendo Typhimurium o mais representado na coleção, com 31 isolados, seguido de Panama com 26 isolados, Newport com 25 e Sandiego e IV 43:z4z24z:-, ambos com 12 isolados. Os demais sorovares foram encontrados variando em número de 1 a 10 isolados. Foram identificados 142 genes de virulência, pelo programa Abricate. Entre eles, 45 foram encontrados em todos os 184 isolados. Análises de filogenia, como multi locus sequence typing (MLST) e single nucleotide polymorphisms (SNPs) de core genoma foram realizadas. O sequence type (ST) de cada isolado foi acessado pela plataforma Enterobase, onde foram identificados 35 STs na coleção de amostras. Dados de filogenia com base em MLST e SNPs de core genoma demonstraram a diversidade da coleção de amostras. Os resultados obtidos nesse estudo são únicos e podem auxiliar a compreensão da filogenia de bactérias do gênero Salmonella e virulência desses microrganismos disseminados em corpos d’água de regiões agrícolas do Rio de Janeiro. | pt_BR |
| dc.embargo.terms | aberto | pt_BR |
| dc.identifier.citation | MOURA, V. de C. (2023). Identificação e caracterização molecular de perfis de virulência de Salmonella sp. obtidas a partir de águas superficiais de regiões agrícolas do Rio de Janeiro [Trabalho de conclusão de curso, Universidade Federal do Rio de Janeiro]. Repositório Institucional Pantheon. | pt_BR |
| dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/11422/20671 | |
| dc.language | por | pt_BR |
| dc.publisher | Universidade Federal do Rio de Janeiro | pt_BR |
| dc.publisher.country | Brasil | pt_BR |
| dc.publisher.department | Instituto de Microbiologia Paulo de Góes | pt_BR |
| dc.publisher.initials | UFRJ | pt_BR |
| dc.rights | Acesso Aberto | pt_BR |
| dc.subject | Salmonella | pt_BR |
| dc.subject | Virulência | pt_BR |
| dc.subject | Águas superficiais | pt_BR |
| dc.subject | Virulence | pt_BR |
| dc.subject | Surface waters | pt_BR |
| dc.subject.cnpq | CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::MICROBIOLOGIA | pt_BR |
| dc.subject.cnpq | CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::IMUNOLOGIA | pt_BR |
| dc.title | Identificação e caracterização molecular de perfis de virulência de Salmonella sp. obtidas a partir de águas superficiais de regiões agrícolas do Rio de Janeiro | pt_BR |
| dc.type | Trabalho de conclusão de graduação | pt_BR |